Para a estrutura orgânica no LEC-EPE, propôs-se uma organização interna, conforme o funcionamento encontrado, com introdução de ajustes consideradas necessárias para a melhoria dos serviços.
Foram definidas e determinadas, que algumas unidades orgânicas tivessem funções de apoio estratégico ao Conselho Administração, a mais estruturante, e outras mais funcionais, na dependência destas últimas, conforme ilustra a figura a seguir.